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荣耀9X短信图标消失可能有多种原因，以下是一些可能的解决方法。
1、检查应用程序是否被禁用或隐藏：进入“设置”，找到并点击“应用管理”，查看是否禁用了短信应用，如果禁用了，请启用它，检查是否设置了隐藏应用，可能在隐藏应用中找到了短信应用。
2、查找桌面布局或抽屉风格：荣耀手机可能采用了抽屉风格的应用界面，所有应用都被放在抽屉里，尝试在桌面空白处长按或点击“设置”查看桌面布局或抽屉风格，确保短信应用没有被移动到其他位置或被删除。
3、尝试重启设备或恢复出厂设置：有时设备出现问题可能导致应用图标消失，尝试重启设备看看问题是否解决，如果问题仍然存在，并且没有其他重要的数据需要保留，可以尝试恢复出厂设置，但请注意，这将删除所有数据，所以请在恢复出厂设置之前备份重要数据。
4、检查系统更新：确保手机系统是最新的版本，有时厂商会发布更新来解决一些已知的问题，进入“设置”，找到并点击“软件更新”，查看是否有可用的更新。
5、排除第三方应用冲突：某些第三方应用可能会与系统应用冲突，导致短信图标消失，尝试卸载最近安装的应用，看看问题是否解决。
如果以上方法都不能解决问题，建议联系华为客服或到附近的华为售后服务中心寻求帮助。